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PAT está diseñado pensando en la facilidad de uso. En la página principal existen unos enlaces que conducen a cada uno de los casos. En dichos enlaces puede verse el autor de cada caso y el número del mismo.
Haciendo clic sobre cualquiera de ellos, se llega a una pantalla en la que se puede leer el caso y ver la iconografía de forma completa.

Cada caso está dividido en unas secciones, pudiendo en ocasiones si el autor lo ha diseñado de esa manera, faltar algunas.

• La primera sección corresponde a los datos del autor, lugar de trabajo dirección, etc.
• La segunda sección es la historia clínica, del caso presentado.
• La tercera sección es una descripción macroscópica de la lesión que se presenta.
• La cuarta sección corresponde a la iconografía. Aquí se pueden ver todas las imágenes del caso aparececiendo a su derecha un breve pie de foto. Haciendo clic sobre una imagen se abre una ventana nueva con la misma imagen pero al tamaño enviado por el autor
• En la quinta sección se recogen los comentarios que han sido enviados por los patólogos que han visitado el Foro. Los mensajes se presentan en órden cronológico. Existe al final de la sección un enlace mediante el cual el visitante al foro pueden escribir un nuevo comentario.
  Cuando se escribe un nuevo comentario, el sistema envía un mensaje al autor del caso avisándole de esta circunstancia, tambien se envia un mensaje con el texto del comentario a la lista PATOLOGIA o PATOCITO (según decisión del autor), y por último, el comentario queda registrado en el Web, pudiéndose leer en la página.
• La sexta sección corresponde al diagnóstico emitido por el autor. El diagnóstico en ocasiones no a aparece hasta un tiempo después de haber sido publicado el caso en el web, con el objeto de estimular un debate sobre el caso presentado.
• La séptima sección son los comentarios que el autor realiza al caso o a los otros comentarios recibidos en el foro o en la listas.
• La última sección son las referencias bibliográficas del caso.