Desde hace años se conocen diversas traslocaciones cromosómicas asociadas de manera específica a numerosos tipos de sarcomas óseos y de partes blandas, incluidos los "tumores de células pequeñas y redondas" (Figs. 1 y 2). El intercambio de material genético origina genes híbridos que flanquean el punto de rotura. Dichos genes se transcriben, originando RNAs (transcritos) quiméricos, y se traducen como proteínas quiméricas (Fig. 3), que son oncogénicas (Ouchida et al., 1995).
Tradicionalmente estas traslocaciones se pueden detectar mediante cariotipos. Estos son, sin embargo, laboriosos, requieren grandes cantidades de tejido, y ofrecen resultados en sólo la mitad de los casos. En los últimos 4 años se han clonado los genes quiméricos, lo que ha permitido conocer su secuencia y diseñar técnicas moleculares apropiadas para detectarlos en muestras clínicas. Los genes de fusión y sus transcritos quiméricos pueden ser fácilmente detectados mediante PCR con transcripción inversa (Fig. 4). En esta técnica se parte del RNA tumoral, sobre el que se realiza en un primer paso una transcripción inversa a DNA complementario. Este se amplifica mediante PCR en la que se emplean primers específicos para los exones que flanquean los puntos de rotura. Se puede realizar con posterioridad una segunda PCR con una segunda pareja de primers ligeramente más cercanos al punto de rotura (PCR anidada o nested) (Fig. 5). Este segundo paso aumenta enormemente la sensibilidad de la técnica y las posibilidades de contaminación. Los productos de la RT-PCR se someten entonces a electroforesis. El DNA contenido en el gel de electroforesis puede trasferirse a una membrana de nylon. Dicha membrana puede entonces incubarse con un DNA complementario (sonda) al DNA que se esperaba encontrar (Southern blot) (Fig. 6). Al marcar la sonda, ésta nos permite conocer qué bandas de las obtenidas en la RT-PCR contenían la secuencia que buscábamos. Esta técnica permite no sólo un aumento adicional de sensibilidad, sino también una gran especificidad.
